RM 8375 微生物基因組DNA標(biāo)準(zhǔn)品的使用說明

RM 8375 微生物基因組DNA標(biāo)準(zhǔn)品的使用說明

品牌：NIST標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)

RM Number（貨號(hào)）：RM 8375

Description：Microbial Genomic DNA Standards for Sequencing Performance Assessment (MG-001, MG-002, MG-003, MG-004)

描述：微生物基因組DNA標(biāo)準(zhǔn)品

Unit of Issue（產(chǎn)品規(guī)格）：4 vials, 1 each

儲(chǔ)存：RM 8375 在 NIST 的 –20 °C 溫度下儲(chǔ)存，但將與冷凍包裝一起運(yùn)輸，并且可能不會(huì)冷凍到達(dá)。收到后，RM 8375 應(yīng)在 –20 °C 的黑暗中長(zhǎng)期儲(chǔ)存，或在 4 °C 的黑暗中短期儲(chǔ)存（如果可能在大約 8 周內(nèi)使用）。

RM 8375 微生物基因組DNA標(biāo)準(zhǔn)品的使用說明

       使用說明：建議使用基因組序列來評(píng)估變異調(diào)用的準(zhǔn)確性，而不是基因組組裝，因?yàn)檎粶y(cè)量方法對(duì)基因組序列結(jié)構(gòu)存在分歧，無法解決差異。 由于與用于評(píng)估堿基調(diào)用準(zhǔn)確性的方法相關(guān)的復(fù)雜性以及基因組序列中的潛在錯(cuò)誤，強(qiáng)烈建議用戶手動(dòng)檢查具有高堿基調(diào)用錯(cuò)誤率的推定區(qū)域周圍的對(duì)齊讀數(shù)。

       這些組件基于來自多種測(cè)量方法的數(shù)據(jù);我們使用多種正交方法對(duì)材料進(jìn)行了評(píng)估，以盡量減少與單個(gè)平臺(tái)相關(guān)的系統(tǒng)誤差的影響。 這些數(shù)據(jù)分別作為MG-001、MG-002、MG-003和MG-004的生物樣本SAMN02854572 、SAMN02854573、SAMN02854574和SAMN02854575在美國國家生物技術(shù)信息中心（NCBI）序列讀取檔案（SRA）中提供[4]。 隨著測(cè)序技術(shù)和分析方法的改進(jìn)，基因組序列將在 Github 站點(diǎn)上更新并提供（參見上面的“信息值"）。 新的版本號(hào)將指示更新的基因組序列以及描述更改的文本文件。 在參考基因組中發(fā)現(xiàn)錯(cuò)誤的用戶可以在參考文獻(xiàn) 5 中顯示的站點(diǎn)上發(fā)布他們的結(jié)果，確認(rèn)的錯(cuò)誤將被納入下一次序列更新。  

部分NIST標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)產(chǎn)品目錄（僅列舉小部分）：